Η έδρα του Aegean College βρίσκεται στο μητροπολιτικό κέντρο της Αθήνας, σε ένα επιβλητικό κτήριο επί της οδού Πανεπιστημίου 17.
Εκεί στεγάζονται οι ακαδημαϊκές και διοικητικές υπηρεσίες του Κολλεγίου, παράλληλα με αίθουσες διδασκαλίας, εργαστήρια και in-house clinics.
Στις εγκαταστάσεις της Αθήνας βρίσκεται η έδρα των εξής Σχολών: Διοίκηση Επιχειρήσεων, Τουρισμός, Πληροφορική, Υγεία, Ανθρωπιστικές Επιστήμες.